Clostridium difficile עלול לגרום לדלקת מעי בדרגות חומרה שונות, התסמין העיקרי הוא שלשול קשה ומתמשך. והוא הזיהום הנרכש בבי"ח הנפוץ ביותר. הטיפול הוא ב metronidazole ו vancomycin P.O. – חיידק זה מסוכן גם בגלל הקלות שבה הוא מדבק, וגם בגלל שהוא עלול לגרום למצבים מסכני חיים ולמוות.
Pseudomembranous colitis הוא דלקת מעי מקלוסטרידיואידס דיפיצילה אצל חולים שקיבלו פיפרצילין/טזובקטם. כאשר מקבלים אנטיביוטיקה מסוג זה לאורך זמן, היא גורמת לחיסול החיידקים הטובים במעיים ושגשוג של C. difficile
